Семинар 7. Предсказание структуры и функции белков

Реализовать программу считывания файла в формате DSSP (на примере структуры 1ATP (E).

С помощью программы Psipred (http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/) предсказать вторичную структуру 1ATP(E) и сравнить с помощью меры Q3.

1ATP:E|PDBID|CHAIN|SEQUENCE GNAAAAKKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVV KLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSL DLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFA DQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKG PGDTSNFDDYEEEEIRVSINEKCGKEFTEF