Семинар 2
Среда, 20 сентября 2017
НГУ, ауд. 5239, НГУ, новый корпус
Задание 2.1 Сравнение двух бактериальных геномов (4 балла)
Имеются 2 gbk-файла с геномами близкородственных бактерий. Написать программу для их погенного сравнения: поиска общей и отличающихся частей. (+ 4 балла за визуализацию двух геномов с выделением общей части и отличающихся частей).
Задание 2.2 Списки ортологичных генов (5 баллов)
С помощью KEGG API для заданного гена (например, hsa:6688) найти список его ортологов с порогами по identity и SW-score. Из этого списка выделить все возможные синонимы этого гена. Показать, какие из этих синонимов не встречаются в описании исходного гена.